Има много често използвани методи за екстракция в китайската медицина. Извличането на китайска медицина с различни химически компоненти трябва да избере подходящия метод. Общите методи за екстракция включват: екстракция с вода, екстракция с органичен разтворител, екстракция с кисели или алкални органични разтворители, парна дестилация, ензимна хидролиза или инхибиране на ензимна хидролиза, химическо третиране, сублимационна екстракция, суперкритична екстракция, ултразвукова екстракция, микровълнова екстракция.
Повечето екстракции в китайската медицина използват процеси на екстракция като екстракция с разбъркване или динамична екстракция с циркулация на помпа, тъй като разбъркването и екстракцията с течен разтворител могат да подобрят ефекта на екстракция и скоростта на екстракция. Поради увеличаването на разликата в концентрацията и налягането във вътрешния край на капиляра на лекарствения материал е по-голямо от налягането във външния край, екстрактът вътре в лекарствения материал непрекъснато тече през капиляра в разтворителя.